Perairan Nusantara memiliki gambaran relief( topografi) dasar laut yang sangat unik dan beragam. Dalam kawasan yang terbatas ini, kita dapat menemukan semua tipe topografi dasar laut seperti paparan dangkal, depresi dalam dengan berbagai bentuk seperti palung, elevasi berupa punggung, gunung bawah air, dan terumbu karang.